MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 5819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_002679	CGG	2	6	222532	222537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488255
3502	NC_002679	CGG	2	6	222556	222561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488255
3503	NC_002679	CAA	2	6	222562	222567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488255
3504	NC_002679	TGC	2	6	222587	222592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488255
3505	NC_002679	AAC	2	6	222611	222616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488255
3506	NC_002679	ACG	2	6	222708	222713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488255
3507	NC_002679	AGC	2	6	222735	222740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488255
3508	NC_002679	GCC	2	6	222791	222796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488255
3509	NC_002679	CAG	2	6	222824	222829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488255
3510	NC_002679	GAA	2	6	222895	222900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488255
3511	NC_002679	AGG	2	6	222976	222981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488255
3512	NC_002679	CCG	2	6	223014	223019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488255
3513	NC_002679	GA	3	6	223105	223110	50 %	0 %	50 %	0 %	13488132
3514	NC_002679	CGA	2	6	223116	223121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488132
3515	NC_002679	CGCAA	2	10	223191	223200	40 %	0 %	20 %	40 %	13488132
3516	NC_002679	CAG	2	6	223230	223235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488132
3517	NC_002679	GTC	2	6	223244	223249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488132
3518	NC_002679	GCC	2	6	223261	223266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488132
3519	NC_002679	TTC	2	6	223312	223317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488132
3520	NC_002679	CGA	2	6	223364	223369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488132
3521	NC_002679	CTT	2	6	223619	223624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488133
3522	NC_002679	GCTG	2	8	223646	223653	0 %	25 %	50 %	25 %	13488133
3523	NC_002679	AAG	2	6	223663	223668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488133
3524	NC_002679	GTTGAA	2	12	223736	223747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488133
3525	NC_002679	GTC	3	9	223778	223786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488133
3526	NC_002679	AACG	2	8	223850	223857	50 %	0 %	25 %	25 %	13488133
3527	NC_002679	TTCCC	2	10	223864	223873	0 %	40 %	0 %	60 %	13488133
3528	NC_002679	AGCC	2	8	223986	223993	25 %	0 %	25 %	50 %	13488133
3529	NC_002679	TCT	2	6	224001	224006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488133
3530	NC_002679	GTTCGC	2	12	224768	224779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488256
3531	NC_002679	CGG	2	6	224789	224794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488256
3532	NC_002679	TTC	2	6	224805	224810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488256
3533	NC_002679	CGC	2	6	224879	224884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488256
3534	NC_002679	TGA	2	6	224960	224965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488256
3535	NC_002679	TTGTGT	2	12	225506	225517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488257
3536	NC_002679	CG	3	6	225697	225702	0 %	0 %	50 %	50 %	13488257
3537	NC_002679	CAAGG	2	10	225728	225737	40 %	0 %	40 %	20 %	13488257
3538	NC_002679	CAC	2	6	225770	225775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488257
3539	NC_002679	GAA	2	6	225793	225798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488257
3540	NC_002679	GCTT	2	8	225813	225820	0 %	50 %	25 %	25 %	13488257
3541	NC_002679	GCT	2	6	225955	225960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488257
3542	NC_002679	CGG	2	6	226029	226034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488257
3543	NC_002679	AAG	2	6	226052	226057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488257
3544	NC_002679	CCCG	2	8	226088	226095	0 %	0 %	25 %	75 %	13488257
3545	NC_002679	TGG	2	6	226099	226104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488257
3546	NC_002679	CGC	2	6	226134	226139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488257
3547	NC_002679	TCGA	2	8	226271	226278	25 %	25 %	25 %	25 %	13488257
3548	NC_002679	ACG	2	6	226329	226334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488257
3549	NC_002679	TGC	2	6	226401	226406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488257
3550	NC_002679	CGG	2	6	226407	226412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488257
3551	NC_002679	CAG	2	6	226589	226594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488257
3552	NC_002679	GGCA	3	12	226613	226624	25 %	0 %	50 %	25 %	13488257
3553	NC_002679	GAA	2	6	226790	226795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488258
3554	NC_002679	CAA	2	6	226831	226836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488258
3555	NC_002679	TGG	2	6	226966	226971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488258
3556	NC_002679	GCG	2	6	227012	227017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488258
3557	NC_002679	GCGG	2	8	227036	227043	0 %	0 %	75 %	25 %	13488258
3558	NC_002679	ATG	2	6	227093	227098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488339
3559	NC_002679	TGC	2	6	227141	227146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488339
3560	NC_002679	CCT	2	6	227157	227162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488339
3561	NC_002679	CGA	2	6	227166	227171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488339
3562	NC_002679	ACG	2	6	227300	227305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488339
3563	NC_002679	GGC	2	6	227332	227337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488339
3564	NC_002679	AG	3	6	227369	227374	50 %	0 %	50 %	0 %	13488339
3565	NC_002679	C	6	6	227413	227418	0 %	0 %	0 %	100 %	13488339
3566	NC_002679	GCAG	2	8	227445	227452	25 %	0 %	50 %	25 %	13488339
3567	NC_002679	TGG	2	6	227523	227528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488339
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3569	NC_002679	ATT	2	6	227624	227629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13488339
3570	NC_002679	GGC	3	9	228280	228288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488259
3571	NC_002679	TGG	2	6	228291	228296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488259
3572	NC_002679	GAAG	2	8	228316	228323	50 %	0 %	50 %	0 %	13488259
3573	NC_002679	TGC	2	6	228376	228381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488259
3574	NC_002679	GAAG	2	8	228532	228539	50 %	0 %	50 %	0 %	13488259
3575	NC_002679	TCG	2	6	228552	228557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488259
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3577	NC_002679	CGC	2	6	228588	228593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488259
3578	NC_002679	GC	3	6	228636	228641	0 %	0 %	50 %	50 %	13488259
3579	NC_002679	TA	3	6	228784	228789	50 %	50 %	0 %	0 %	13488259
3580	NC_002679	CGC	2	6	228796	228801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488259
3581	NC_002679	GCC	2	6	228844	228849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488259
3582	NC_002679	TCA	2	6	228882	228887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488259
3583	NC_002679	TCGG	2	8	228908	228915	0 %	25 %	50 %	25 %	13488259
3584	NC_002679	CGGC	2	8	228978	228985	0 %	0 %	50 %	50 %	13488259
3585	NC_002679	GCG	2	6	228986	228991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488259
3586	NC_002679	CAA	2	6	228995	229000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488259
3587	NC_002679	GGC	2	6	229034	229039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488259
3588	NC_002679	GAG	2	6	229104	229109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488259
3589	NC_002679	TGA	2	6	229116	229121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488260
3590	NC_002679	GAT	2	6	229132	229137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488260
3591	NC_002679	GTTCT	2	10	229283	229292	0 %	60 %	20 %	20 %	13488260
3592	NC_002679	GGC	2	6	229318	229323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488260
3593	NC_002679	TCGGC	2	10	229377	229386	0 %	20 %	40 %	40 %	13488260
3594	NC_002679	TCG	2	6	229392	229397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488260
3595	NC_002679	GATC	2	8	229446	229453	25 %	25 %	25 %	25 %	13488261
3596	NC_002679	TTG	2	6	229468	229473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488261
3597	NC_002679	CGG	2	6	229559	229564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488261
3598	NC_002679	GC	3	6	229720	229725	0 %	0 %	50 %	50 %	13488261
3599	NC_002679	CG	3	6	229751	229756	0 %	0 %	50 %	50 %	13488262
3600	NC_002679	TGA	2	6	229766	229771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488262
3601	NC_002679	TCG	2	6	229793	229798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488262
3602	NC_002679	CGA	2	6	229844	229849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488262
3603	NC_002679	CGAT	2	8	229915	229922	25 %	25 %	25 %	25 %	13488262
3604	NC_002679	TCGAG	2	10	230035	230044	20 %	20 %	40 %	20 %	13488262
3605	NC_002679	CGG	2	6	230086	230091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488262
3606	NC_002679	GCG	2	6	230141	230146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488262
3607	NC_002679	CGG	2	6	230170	230175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488262
3608	NC_002679	CGAG	2	8	230227	230234	25 %	0 %	50 %	25 %	13488262
3609	NC_002679	TGA	2	6	230263	230268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488262
3610	NC_002679	GA	3	6	230278	230283	50 %	0 %	50 %	0 %	13488262
3611	NC_002679	GC	3	6	230299	230304	0 %	0 %	50 %	50 %	13488262
3612	NC_002679	CGT	2	6	230315	230320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488262
3613	NC_002679	CGA	2	6	230434	230439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488262
3614	NC_002679	CAT	2	6	230510	230515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488262
3615	NC_002679	CAT	2	6	230609	230614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488262
3616	NC_002679	GC	3	6	230712	230717	0 %	0 %	50 %	50 %	13488262
3617	NC_002679	GAC	2	6	230790	230795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488262
3618	NC_002679	CCTG	2	8	230894	230901	0 %	25 %	25 %	50 %	13488262
3619	NC_002679	GC	3	6	230919	230924	0 %	0 %	50 %	50 %	13488262
3620	NC_002679	GAC	2	6	231032	231037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488262
3621	NC_002679	CTT	2	6	231053	231058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488262
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3623	NC_002679	TGC	2	6	231124	231129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488262
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3874	NC_002679	CGT	2	6	243293	243298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488273
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3991	NC_002679	GTC	2	6	249426	249431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488278
3992	NC_002679	TTC	2	6	249444	249449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488278
3993	NC_002679	CGC	2	6	249629	249634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488278
3994	NC_002679	TGC	2	6	249676	249681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488278
3995	NC_002679	CGGT	2	8	249759	249766	0 %	25 %	50 %	25 %	13488278
3996	NC_002679	GAT	2	6	249767	249772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488278
3997	NC_002679	GGCGG	2	10	249918	249927	0 %	0 %	80 %	20 %	13488278
3998	NC_002679	CG	3	6	249935	249940	0 %	0 %	50 %	50 %	13488278
3999	NC_002679	CGT	2	6	249983	249988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488278
4000	NC_002679	GCC	2	6	249990	249995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488278

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